犬葡萄糖激酶调节蛋白的生物信息学分析
刘迪瑄
袁鸣欣
肖鹏硕
刘蕊
刘博远
庞若玉
宋书峰
马学婧
沧州师范学院生命科学系,河北 沧州 061001
摘要：试验旨在探讨犬葡萄糖激酶调节蛋白(glucokinase regulatory protein,GCKR)的结构、功能及表达.试验采用生物信息学方法对犬GCKR蛋白的理化性质、亲/疏水性、同源性和保守基序、信号肽和跨膜区、二级结构、结构域、三级结构、磷酸化修饰、相互作用蛋白质和GO注释、亚细胞定位、基因结构、启动子和转录调控进行了研究.结果显示:犬GCKR蛋白是一种不稳定酸性亲水蛋白质,与马的亲缘关系较近,没有信号肽和跨膜区;二级结构由α-螺旋(47.36%)、延伸链(12.00%)、β-转角(4.48%)和无规则卷曲(36.16%)构成,含有2个糖异构酶结构域;三级结构以马GCKR蛋白为模板构建且质量较高.犬GCKR蛋白含有28个磷酸化位点,其相互作用蛋白包括葡萄糖激酶、酰胺水解酶结构域2、锌指蛋白512等,并参与糖代谢,主要定位于内质网;其基因具有19个外显子和18个内含子,启动子位于第1 302～1 352 bp,转录因子如Ncx、POU1F1a、C/EBPdelta可与启动子结合.研究表明,犬GCKR蛋白可能参与犬糖尿病的发生机制,可作为研发相关药物的潜在靶标.
关键词：GCKR犬糖尿病蛋白结构蛋白表达生物信息学
分类号：S829.3(家畜)
资助基金：沧州师范学院大学生科技创新能力培育专项(DX-SYBL2023007)河北省教育厅科学技术研究项目(QN2020515)沧州师范学院校内科研基金项目(XNJJLQN2021002)沧州市自然科学基金项目(221001002D)沧州师范学院科研创新团队(cxtdl2303)
论文发表日期：2024-04-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 17-24 )
英文信息