基于全基因组重测序分析木垒长眉双峰驼的遗传多样性与群体结构
李永凤1
张心坦2
霍飞2
梁慧慧2
耿娟2
1.新疆农业大学动物科学学院,新疆 乌鲁木齐 8300002.新疆维吾尔自治区畜牧总站,新疆 乌鲁木齐 830000
摘要：试验旨在探究木垒长眉双峰驼群体结构、遗传多样性,以期为进一步挖掘木垒长眉双峰驼资源、保护和利用木垒长眉双峰驼提供参考.采集木垒长眉双峰驼、准噶尔双峰驼和新疆塔里木双峰驼共60个血液样本(3个种群各选20峰,其中公驼5峰、母驼15峰),利用全基因组重测序技术对样本进行高通量测序,利用邻域连接法构建种群系统进化树、主成分(PCA)分析,使用软件检测样本的纯合性(ROH),进行群体结构和遗传多样性分析.结果显示:60个样本测序后平均Q20和Q30分别为98.90%和95.09%,GC含量平均为42.34%;检测到15 305 199个单核苷酸多型性(SNPs).木垒长眉双峰驼具有独立的祖先来源,而准噶尔双峰驼和新疆塔里木双峰驼则表现同一祖先来源,且木垒长眉双峰驼的近交程度最高,遗传多样性较低.研究表明,建议对木垒长眉双峰驼进行科学选种选配,避免因近交衰退造成群体生产性能下降.
关键词：双峰驼全基因组重测序群体遗传结构遗传多样性
分类号：S824(家畜)
资助基金：新疆维吾尔自治区重大科技专项项目(2023A02011)
论文发表日期：2024-12-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 24-28 )
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