SARS病毒基因组所编码的E蛋白的二级结构和B细胞表位预测
吕燕波
万瑛
吴玉章
1.第三军医大学免疫学教研室,全军免疫研究所,重庆,4000382.第三军医大学免疫学教研室,全军免疫研究所,重庆,4000383.第三军医大学免疫学教研室,全军免疫研究所,重庆,400038
摘要：目的预测SARS病毒E蛋白的B细胞表位和二级结构.方法以SARS病毒基因组序列为基础,采用Gar-nier-Robson方法、Chou-Fasman方法和Karplus-Schultz方法预测E蛋白质的二级结构;用Kyte-Doolittle方案预测蛋白质的亲水性;用Emini方案预测蛋白质的表面可能性;用Jmeson-Wolf方案预测氨基酸的抗原性指数.综合评判,预测SARS病毒E蛋白的B细胞表位.结果在SARS病毒E蛋白N-端的第1～6、13～19、39～43、47～64区段和第73～76区段有β-折叠中心;第6～12区段和第67～69区段可能形成转角或无规则卷曲,是柔性区域.E蛋白N端第2～13区段和第61～74区段为B细胞优势表位区域.结论用多参数预测SARS病毒E蛋白的二级结构和B细胞表位,为实验方法探索SARS冠状病毒E蛋白的B细胞表位提供理论依据.
关键词：SARS病毒E蛋白B细胞表位二级结构预测
分类号：R392.11(医学免疫学)
论文发表日期：2003-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 407-410 )
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