基于SCORE函数估算HLA-A*0201限制性CTL表位亲和性
朱波1
林治华2
陈正堂1
吴玉章3
1.第三军医大学新桥医院全军肿瘤中心,重庆 4000372.重庆工学院生物工程学院,重庆 4000503.第三军医大学基础部全军免疫学研究所,重庆 400038
摘要：目的建立HLA-A*0201限制性CTL表位亲和性的定量预测方法.方法基于SCORE打分函数,运用定量构效关系的理论和方法研究了HLA-A*0201限制性CTL表位九肽结构与亲和性间的定量关系,并建立了SCORE得分与亲和性的定量关系模型,并用外部样本(5个HLA-A*0201限制性CTL表位九肽)作为预测集用于检验模型的预测能力.结果基于SCORE打分函数建立的定量模型具有较好的相关性(r=0.9165,RMS=0.38)和对外部样本的预测能力(rpred=0.9847,RMS=0.135).结论基于SCORE打分函数,运用定量构效关系研究的理论和方法建立了HLA-A*0201限制性CTL表位亲和性的定量预测方法,为实验鉴定高亲和性HLA-A*0201限制性CTL表位提供了理论依据.
关键词：SCORE函数HLA-A*0201CTL表位亲和性
分类号：R392.11(医学免疫学)R394.2(医学遗传学)
资助基金：国家自然科学基金(30490240,30471579,30300150)国家重点基础研究发展计划（973计划）(2001CB510001)
论文发表日期：2005-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 177-181 )
英文信息