CT抗原KM-HN-1 HLA-A * 0201限制性表位预测及其与HLA-A * 0201结合强度分析
王昊亮
付晓岚
姜曼
黎万玲
唐艳
吴玉章
1.第三军医大学基础医学部全部免疫学研究所,重庆,4000382.第三军医大学基础医学部全部免疫学研究所,重庆,4000383.第三军医大学基础医学部全部免疫学研究所,重庆,4000384.第三军医大学基础医学部全部免疫学研究所,重庆,4000385.第三军医大学基础医学部全部免疫学研究所,重庆,4000386.第三军医大学基础医学部全部免疫学研究所,重庆,400038
摘要：目的 通过对CT抗原(cancer-testis antigen)KM-HN-1进行HLA-A * 0201限制性表位预测,并对候选表位肽与HLA-A*0201分子结合亲和力及复合物稳定性进行分析,为探索基于KM-HN-1的免疫治疗奠定基础.方法 利用基于蛋白酶体剪切位点特异性的算法PAProc及基于肽MHC-Ⅰ结合的算法BIMAS和SYFPEITHI对KM-HN-1进行HLA-A*0201限制性表位预测;合成KM-HN-1相关候选表位肽KM-HN-1321-329(KLLPFRETV),KM-HN-1203-211(FLPTAPPNV),KM-HN-1629-637(TLLQIIETV),KM-HN-187-95(ILNKSIIEV),KM-HN-1538-546(QMMEALDQL)及阳性对照肽HBVcAg18-27(FLPSDFFPSV);对这些合成肽与HLA-A*0201分子结合亲和力及其复合物稳定性根据文献报道的方法进行分析.结果 KM-HN-1321-329(KLLPFRETV)结合亲和力最低,KM-HN-1203-211(FLPTAPPNV)结合亲和力最高,其余3条肽结合亲和力介于2者之间;稳定性实验(DC50)结果显示:KM-HN-1538-546(QMMEALDQL)DC50小于2 h,KM-HN-1321-329(KLLPFRETV)的DC50介于2～4 h之间,KM-HN-187-95(ILNKSIIEV)的DC50介于6～8 h之间,KM-HN-1203-211(FLPTAPPNV)及KM-HN-1629-637(TLLQIITV)的DC50均大于8 h.结论 基于蛋白酶体剪切位点特异性的算法及基于肽MHC-Ⅰ结合的算法对KM-HN-1进行HLA-A*0201限制性表位预测,结合候选表位肽与HLA-A*0201分子结合的亲和力与复合物稳定性实验分析,为该抗原HLA-A*0201限制性表位的鉴定奠定了基础.
关键词：CT抗原KM-HN-1表位预测HLA-A*0201限制性结合亲和力及稳定性
分类号：R392.3(医学免疫学)
资助基金：国家重点基础研究发展计划（973计划）(2003CB514108)国家自然科学基金(30300315)
论文发表日期：2006-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 593-596 )
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