铜绿假单胞菌噬菌体PaP3全基因组在感染宿主菌PA3过程中的分时期表达研究
陈灿煌
赵霞
王竞
胡福泉
谭银玲
1.第三军医大学基础医学部微生物学教研室, 重庆,4000382.第三军医大学基础医学部微生物学教研室, 重庆,4000383.第三军医大学基础医学部微生物学教研室, 重庆,4000384.第三军医大学基础医学部微生物学教研室, 重庆,4000385.第三军医大学基础医学部微生物学教研室, 重庆,400038
摘要:目的 明确铜绿假单胞菌噬菌体PaP3在感染宿主菌PA3后其全基因组的分时期表达模式.方法 利用基因芯片检测噬菌体PaP3在感染宿主菌PA3后不同时间(5 min,10min,20min,30 min,80 min)其全基因组(含71个预测的ORF)在转录水平的表达谱变化,并进行非临督层次聚类(hierarchical clustering)分析.利用蛋白质合成抑制剂氯霉素(Cm)和DNA复制抑制剂磷酸乙酸(PAA)实验确定PaP3全基因组的分时期表达情况.结果 根据时间表达模式的不同,PaP3全基因组可分为3大类:15个早期基因(ORF 71-57)、35个中期基因(ORF 56-22)及21个晚期基因(ORF 21-1).在PaP3基因组结构中,这3类基因各自串联分布且可能受不同的操纵子调控.结论 PaP3感染过程中其早期、中期及晚期基因随时间有序表达,为深入了解噬菌体基因表达模式及生命复制周期奠定基础,并为了解噬菌体与宿主及机体免疫系统的的相互作用提供了基础.
关键词:噬菌体基因芯片早期基因中期基因晚期基因
分类号:R378.99+(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))
资助基金:国家自然科学基金(30770093)重庆市自然科学基金重点项目(cstc2012jjB10018)
论文发表日期:2012-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
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