前列腺特异性膜抗原新型剪接变异体PSME基因及蛋白的生物信息学分析
王铸1
冯发深1
何霞1
关林琳1
徐霖1
张定梅1
罗燕芬1
汪杨1
曹开源2
1.中山医学院微生物教研室,广州,5100802.510080广州,中山大学临床检验标准化研究中心;510080广州,中山医学院微生物教研室
摘要：目的 通过对PSME的生物信息学分析,更多的了解该基因及蛋白结构与功能的相关信息.方法 运用生物信息学方法分析PSME基因结构,序列及其编码蛋白的理化性质和结构与功能特征,蛋白相互作用网络以及抗原表位.结果 用ExPASy的Computer PI/Mw、SMA RT等软件对其氨基酸序列进行分析,该蛋白的PI值为6.38,相对分子质量约为78 000.二级结构中α螺旋(H)占34.66％,β折叠(E)占12.93％,无规卷曲占52.41％.PSME信号肽位于1～22位氨基酸,150-248位为肽酶结构域,639～703位为转铁蛋白受体二聚体,且含有多个糖基化位点.通过DNA Star软件分析得到了PSME蛋白的抗原表位.结论 利用生物信息学预测出的结构和功能信息,能为PSME蛋白的相关研究提供信息基础.
关键词：生物信息学抗原新型剪接变异体前列腺特异性膜抗原
分类号：Q71(生物大分子的结构和功能)
资助基金：国家自然科学基金(81071760)
论文发表日期：2012-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
英文信息