甲壳类动物4种过敏原的序列分析、抗原表位预测及三维结构建模
沈海旺
陈亨莉
曹敏杰
蔡秋凤
毛海燕
苏文金
刘光明
1.集美大学生物工程学院福建省高校水产科学技术与食品安全重点实验室,厦门,3610212.集美大学生物工程学院福建省高校水产科学技术与食品安全重点实验室,厦门,3610213.集美大学生物工程学院福建省高校水产科学技术与食品安全重点实验室,厦门,3610214.集美大学生物工程学院福建省高校水产科学技术与食品安全重点实验室,厦门,3610215.集美大学生物工程学院福建省高校水产科学技术与食品安全重点实验室,厦门,3610216.集美大学生物工程学院福建省高校水产科学技术与食品安全重点实验室,厦门,3610217.集美大学生物工程学院福建省高校水产科学技术与食品安全重点实验室,厦门,361021
摘要：目的 探明甲壳类动物各种过敏原之间是否存在相似性,以期深入研究甲壳类食品过敏原的构效关系.方法 应用生物信息学方法,分析预测了甲壳类动物的4种过敏原—原肌球蛋白(TM)、精氨酸激酶(AK)、肌球蛋白轻链(MLC)和肌质钙结合蛋白(SCP)的二级结构、亲水性、可塑性、抗原性、表面可及性、线性抗原表位和三维结构等.结果 TM为超螺旋结构,而AK、MLC和SCP均为复合蛋白,含有较多的Turn和Coil结构;TM、AK、MLC和SCP 4种过敏原的亲水性区域均在60％以上,可塑性区域约为50％,抗原性区域均在60％以上.TM、AK、MLC和SCP分别有11、10、4和4个线性抗原表位.TM、AK、MLC和SCP的三维结构建模结果与相应的二级结构预测结果—致,基本能够反映此4种过敏原的空间构象.结论 通过生物信息学方法分析,同时获得了甲壳类动物4种过敏原TM、AK、MLC和SCP的分子特征、抗原表位及部分三维结构,可望为进—步采用实验方法研究其构效关系奠定理论基础.
关键词：过敏原抗原表位预测三维结构建模
分类号：R392.11(医学免疫学)
资助基金：国家自然科学基金(31171660)福建省自然科学基金(201OJ06012)福建省高等学校新世纪优秀人才支持计划(NCETFJ-2007)集美大学创新团队项目(2010A005)
论文发表日期：2012-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
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