EB病毒表位肽三维定量构效关系的建模与初步分析
周朋朋
唐光辉
刘蒙蒙
汪斌
王远强
林治华
1.重庆理工大学药学与生物工程学院,4000542.重庆理工大学药学与生物工程学院,4000543.重庆理工大学药学与生物工程学院,4000544.重庆理工大学药学与生物工程学院,4000545.重庆理工大学药学与生物工程学院,4000546.重庆理工大学药学与生物工程学院,400054
摘要：目的 建立EBV抗原表位的三维定量构效关系模型,为表位的设计与改造提供理论基础.方法 从表位数据库中收集67条EBV表位抗原,采用比较分子场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)方法研究EBV抗原表位平衡解离常数(KD)和半数抑制浓度(IC50)的三维定量构效关系(3D-QSAR),并建立了相应的3D-QSAR模型.结果 使用CoMFA与CoMSIA方法针对KD和IC50所建立的3D-QSAR模型均有良好的预测能力,定量预测模型的复相关系数:KD (CoMFA:Q2=0.731,R2=0.996;CoMSIA:Q2=0.723,R2=0.979),IC50(CoMFA:Q2=0.463,R2=0.992;CoMSIA:Q2=0.485,R2=0.998).结论 3D-QSAR建模方法具有较强的稳定性和较好的预测能力,而且能够通过等值面图为EBV表位的设计提供可视化信息,为进一步的抗肿瘤多肽疫苗开发提供指导.
关键词：抗原表位比较分子场分析比较分子相似性指数分析三维定量构效关系
分类号：R392.5(医学免疫学)
资助基金：国家自然科学基金(31400667)重庆市基础与前沿研究计划项目(cstc2014jcyja10044)重庆理工大学研究生创新基金(YCX2014229)重庆市教委科学技术研究项目(KJ1500902)重庆市教委科学技术研究项目(KJ1400932)
论文发表日期：2015-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
英文信息