RAW264.7细胞自噬相关circRNA检测及分析
张爱君1
李艳宁1
高倩2
屈昱良1
蒋丹1
王丽燕1
徐广贤3
1.750001银川,宁夏医科大学临床医学院2.710000西安,空军军医大学附属医院检验科3.750001银川,宁夏医科大学临床医学院;523000东莞,广东医科大学医学技术学院医学检验系
摘要：目的 探讨环状RNA(circRNA)表达谱在RAW264.7细胞自噬模型中的差异表达及其在细胞自噬过程中的调控作用.方法 利用雷帕霉素(rapamycin,RAPA)和3-甲基腺嘌呤(3-methyladenine,3-MA)分别作用于小鼠单核巨噬细胞RAW264.7细胞,建立自噬诱导模型和自噬抑制模型;提取各组细胞总RNA,基于高通量测序技术获得差异表达的circRNA;运用生物信息学分析对circRNA可能结合的微小RNA(miRNA)及其可能参与自噬的分子通路进行预测.结果 在RAPA组和3-MA组中呈现相反表达趋势的circRNA共有42个,差异显著的前5个circRNA分别是circRNAmmu_ circ_ 0000353、mmu_ circ_ 0001704、mmu_ circ_ 0013108、mmu_circ_0001528和mmu_ circ_ 0015842,分别对其结合匹配值较高的3个miRNA位点进行预测,GO分析表明这些miRNA与转录调控、炎症反应及免疫应答相关;KEGG分析表明与多条自噬相关通路有关.结论 本研究筛选到的circRNA以及与之结合的miRNA与细胞自噬的发生发展相关,可以此为靶点进行自噬相关的研究,并为自噬调控机制提供基础.
关键词：细胞自噬circRNA高通量测序生物信息学
分类号：R392.12(医学免疫学)
论文发表日期：2022-02-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 177-184 )
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