基于免疫相关miRNA-mRNA作用网络的乳腺癌预后模型建立
黄萍
唱凯
陈鸣
400038 重庆,陆军军医大学第一附属医院检验科
摘要：目的 探讨基于免疫相关microRNA-mRNA作用网络(immune-related miRNA-mRNA network,IRM-MN)的风险回归模型用于评估乳腺癌(breast cancer,BC)组织免疫细胞浸润水平及患者预后的潜力.方法 从TCGA数据库(The Cancer Genome Atlas)和GEO数据库(Gene Expression Omnibus DataSets)获取转录组数据与临床数据,通过差异分析、共表达分析和LASSO(Least Absolute Shrinkage and Selection Operator)回归分析筛选出差异表达的免疫相关miRNAs 与 mRNAs;通过 COX 回归分析筛选出与BC预后相关的、差异表达的免疫相关miRNAs与mRNAs并构建预后风险评分模型;使用Kaplan-Meier生存分析、ROC曲线、单/多因素独立预后分析和相关性分析评价模型的预测能力.结果 共筛选出3个与预后相关的差异免疫相关miRNAs及5个与预后相关的差异免疫mRNAs,最终确定2个miRNAs(miR-21-5p和miR-141-3p)和1个mRNA(INHBA)用于构建风险模型.Kaplan-Meier生存分析表明高风险组BC患者预后较差(P＜0.001).ROC曲线结果显示,总体生存率曲线下面积(area under curve,AUC)值为0.893.单因素和多因素的独立预后分析结果显示,模型的风险评分可作为BC患者生存结局评估的独立预后因素(风险比:1.234,P＜0.001).此外,模型的风险评分与巨噬细胞免疫评分存在正相关性.结论 本研究明确了与BC预后相关的特征性差异免疫相关miRNAs和mRNAs.基于IRM-MN作用网络构建的风险回归模型具有较高的预后预测及肿瘤免疫浸润评估价值.因此,该风险模型可为BC患者的预后评估及个性化治疗方案的改善提供可靠的参考.
关键词：乳腺癌免疫相关miRNA-mRNA网络预后
分类号：R737.9(泌尿生殖器肿瘤)R392(医学免疫学)
资助基金：国家自然科学基金(82030066)国家自然科学基金(U23A2047)
论文发表日期：2024-12-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 906-912 )
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