玫瑰β-l,3-葡聚糖合成酶基因(RrCalS)克隆与生物信息学分析
康希泉1
亓帅2
臧德奎2
郑林3
徐宗大2
邢树堂2
于晓艳2
1.胜利油田胜大园林工程有限公司,山东东营,2570002.山东农业大学,山东泰安,2710003.青州市花卉产业管理局,山东青州,262500
摘要:为了探明胼胝质对玫瑰授粉亲和性的影响,本研究以‘唐红’玫瑰花柱为试材,采用RT-PCR和RACE方法获得了玫瑰β-l,3-葡聚糖合成酶基因的cDNA全长,命名为RrCalS.该基因全长5742 bp,开放阅读框5295 bp,编码1764个氨基酸.推导编码蛋白的分子量为204.7kD,PI值为9.00,在164-265位具有pfam14288结构域,在869-1642位具有pfam02364保守结构域,属于葡聚糖合成酶超家族;该蛋白属于疏水性、非分泌型蛋白,具有16个跨膜结构域,含有32个Ser磷酸化位点、21个Thr磷酸化位点、12个Tyr磷酸化位点;该蛋白的α-螺旋占49.49%,无规则卷曲占22.68%,β-转角占7.94%;该蛋白与Fragaria vesca等8种植物的Cals氨基酸序列同源性达73%以上,且它们的系统进化关系与传统分类结果一致.本研究为进一步深入研究玫瑰授粉不亲和机理,提高玫瑰育种理论和技术水平奠定了基础.
关键词:玫瑰β-l3-葡聚糖合成酶基因克隆
资助基金:国家自然科学基金(31200524)国家自然科学基金(31870688)
论文发表日期:2019-01-01
在线出版日期:2026-05-22(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:5( 8-11,22 )
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山东林业科技

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ISSN:1002-2724
年,卷(期):2019,49(2)
所属栏目:研究报告