2020年猪圆环病毒2型云南流行株的分子鉴定及全基因组序列分析
周玉照1
张小苗1
柴俊2
1.大理农林职业技术学院,云南 大理 6710032.云南农业大学动物医学院,云南 昆明
摘要：为了弄清云南省猪圆环病毒2型(PCV-2)的流行和基因变异情况,试验采用PCR鉴定、PCV-2全基因扩增及克隆、PCV-2蛋白氨基酸比对与遗传进化分析、PCV-2 Cap蛋白氨基酸比对分析、PCV-2 Cap蛋白抗原指数预测分析等方法进行研究.结果表明,从43份样品中检测出5份阳性样品,其阳性率为11.63％;成功获得5个大小为1768 bp的PCV-2全基因序列,分别将其命名为YN PCV2-1、YN PCV2-2、YN PCV2-3、YN PCV2-4、YN PCV2-5;获得的5株毒株与国内外毒株氨基酸之间存在差异,同源性在66.8％～99.1％ 之间;5株PCV-2 ORF2基因编码的Cap蛋白氨基酸与5株疫苗株也存在多处氨基酸变异;其中YN PCV2-4 Cap蛋白抗原指数与5株疫苗株的Cap蛋白抗原指数差异性不大,而YN PCV2-1、YN PCV2-2、YN PCV2-3、YN PCV2-5的Cap蛋白抗原指数与5株疫苗株的Cap蛋白抗原指数差异性较大,在5～10,25,40～50,70,172～176,210～223区域的抗原指数均不同于疫苗株.说明云南省流行的猪圆环病毒2型已发生变异.
关键词：PCV-2分子鉴定同源性分析遗传进化分析抗原指数
分类号：S852.65+9.2(动物医学（兽医学）)
论文发表日期：2023-01-28
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 12-16,21 )