花生RGA-SSCP实验条件的优化
漆燕1
李双铃2
袁美2
王辉2
任艳2
石延茂2
崔富华3
李加纳4
禹山林2
1.山东省花生研究所/国家花生工程技术研究中心,山东,青岛,266100;南充市农业科学研究所,四川,南充,637000;西南大学农学与生物科技学院,重庆,4007162.山东省花生研究所/国家花生工程技术研究中心,山东,青岛,2661003.南充市农业科学研究所,四川,南充,6370004.西南大学农学与生物科技学院,重庆,400716
摘要:单链构象多态性(SSCP) 技术是一种简便、灵敏的多态性检测方法,近年在植物研究中得到了较多应用.为了检测花生品种间抗病基因同源序列(RGA)的单核苷酸差异,对影响花生RGA-SSCP的电泳温度、电压、胶浓度、交联度、变性剂等因素进行了优化.结果表明,碱变性后的PCR产物(PCR产物与碱变性剂比例1∶2)在不加甘油的8%非变性聚丙烯酰胺凝胶(交联度为29∶1)、1×TBE电泳缓冲液、恒温4℃和600 V条件下电泳5 h为最佳优化组合.用上述优化方法分析了抗、感北方根结线虫病的亲本及F2群体部分单株,获得了电泳条带细而清晰的SSCP图.该体系的建立对RGA-SSCP标记用于花生基因定位、遗传图谱构建、标记辅助选择等具有重要意义.
关键词:花生RGA-SSCP优化分子标记
分类号:S565.2(经济作物)Q503(一般性问题)
资助基金:国家自然科学基金(30700509)国家高技术研究发展计划(863计划)(08-1-3-23-jch;863;2006AA100106)创新基金(2007YCX013)
论文发表日期:2010-06-02
在线出版日期:2026-05-22(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:5( 1-4,9 )
英文信息
