玉米叶面微生物DNA提取方法及PCR引物的筛选
赵辉1
李世国2
孙红炜3
李凡3
田晓燕1
颜世磊1
路兴波3
1.山东师范大学生命科学学院,山东济南250014;山东省农业科学院植物保护研究所,山东济南 2501002.山东师范大学生命科学学院,山东济南,2500143.山东省农业科学院植物保护研究所,山东济南,250100
摘要:传统的微生物培养方法在反映叶面微生态信息上具有局限性,因此逐渐被分子生态学所代替,而获得高质量、大片段、无偏好的总DNA是研究叶面环境微生物的基础.本文采用改进的Sambrook法、CTAB法、改良的化学法以及试剂盒法对玉米生长初期、中期、末期的叶面微生物总DNA进行提取,并对4种方法提取的DNA片段的大小和产量进行综合评价.将得到的DNA用引物357/518以及984/1387对细菌16S rDNA进行扩增;用5种常见引物NS1/fung、ITSl - F/ITS2、NS1/AM1、EF4/fung5、SSU - 0817/SSU - 1196对真菌18SrDNA进行扩增.结果表明:4种方法提取的DNA片段均适用于PCR,但DNA的得率和纯度有一定差别,其中以试剂盒提取效果最好.PCR结果显示,除化学法外,其他3种方法提取的DNA均能够获得目的条带;并通过比较得出引物984/1387对16S rDNA以及ITS1 - F/ITS2对18S rDNA扩增效果较好且扩增量最大.
关键词:玉米叶面微生物DNA提取PCR16SrDNA18SrDNA
分类号:Q503(一般性问题)
资助基金:转基因生物新品种培育科技重大专项(2009ZX08011-020B)
论文发表日期:2012-01-01
在线出版日期:2026-05-22(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:6( 9-14 )
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山东农业科学

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CSTPCD
ISSN:1001-4942
年,卷(期):2012,44(2)
所属栏目:生物技术·信息技术