向日葵抗坏血酸过氧化物酶的电子克隆和生物信息学分析
孟鹏1
李根英2
陈国强3
王振东1
1.沈阳农业大学生物科学技术学院,辽宁沈阳,1101612.山东省农业科学院作物研究所,山东济南,2501003.淮海工学院/江苏省海洋生物技术重点实验室,江苏连云港,222005
摘要：利用电子克隆技术得到长753 bp的向日葵抗坏血酸过氧化物酶(HaAPX) cDNA.通过生物信息学分析发现,HaAPX在核酸水平和蛋白质水平上都与常见物种的APX非常相似,具有极其保守的酶活作用域Peroxidase_1(- divtlsggHtl -)和Peroxidase_2(- aplmlRlawHsa -),且配体结合位点和金属结合位点完全保守.HaAPX与甘薯(pomoea bataatas)APX亲缘关系很近,其编码蛋白由250个氨基酸组成,分子量为2.7ku,无信号肽和跨膜区,二级结构由37.6％α-螺旋、13.2％β-折叠、9.2％ β-转角和40％无规则卷曲组成,三维构象与豌豆APX的非常相似.
关键词：向日葵抗坏血酸过氧化物酶电子克隆生物信息学
分类号：Q814(酶工程)
资助基金：转基因生物新品种培育科技重大专项(2010-Z24;2009ZX08-002-17B)国家自然科学基金(30871516、30871515)
论文发表日期：2012-01-01
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 1-6 )
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