小偃麦异附加系 TaXTH 基因的克隆与生物信息学分析
黄春丽
宋静
李全权
郭庆东
田秋菊
高居荣
王洪刚
封德顺
1.山东农业大学农学院/国家小麦改良中心泰安分中心/作物生物学国家重点实验室,山东 泰安,2710182.山东农业大学农学院/国家小麦改良中心泰安分中心/作物生物学国家重点实验室,山东 泰安,2710183.山东农业大学农学院/国家小麦改良中心泰安分中心/作物生物学国家重点实验室,山东 泰安,2710184.山东农业大学农学院/国家小麦改良中心泰安分中心/作物生物学国家重点实验室,山东 泰安,2710185.山东农业大学农学院/国家小麦改良中心泰安分中心/作物生物学国家重点实验室,山东 泰安,2710186.山东农业大学农学院/国家小麦改良中心泰安分中心/作物生物学国家重点实验室,山东 泰安,2710187.山东农业大学农学院/国家小麦改良中心泰安分中心/作物生物学国家重点实验室,山东 泰安,2710188.山东农业大学农学院/国家小麦改良中心泰安分中心/作物生物学国家重点实验室,山东 泰安,271018
摘要：本研究运用 GeneFishing 技术，从经过 PEG －6000模拟干旱处理的小偃麦异附加系种质 SN6306的 cDNA 中获得了一个长度为586 bp 的上调表达差异片段7154。通过 NCBI 数据库相似性比对，预测其为木葡聚糖内转糖苷酶／水解酶基因（XTH）的一段序列。经克隆和 RT －PCR 获得 TaXTH 的全长 cDNA 和 DNA 序列，对其核酸和蛋白序列分析的结果表明，TaXTH 全长 DNA 序列为2224 bp，含有3个外显子和2个内含子；其开放阅读框（ORF）长度为936 bp，编码311个氨基酸。BlastP 分析结果显示，TaXTH 属于 GH16蛋白家族。相似性比对分析结果表明，该蛋白与小麦近缘物种二穗短柄草中的同源蛋白一致性达到79％。从多序列联配及系统进化树分析结果中推断 TaXTH 属于 XTH 类，具有典型的 DEIDFEFLG 保守基序。
关键词：小偃麦异附加系TaXTH基因克隆生物信息学分析
分类号：S512.903.4(禾谷类作物)
资助基金：国家自然科学基金(31171552)转基因生物新品种培育科技重大专项(2013ZX08002-003)
论文发表日期：2015-07-02
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 1-6 )
英文信息