野生花生全基因组抗病相关 LOX 基因的生物信息学分析
宋辉1
赵术珍1
侯蕾1
乔善良2
赵传志1
李爱芹1
王兴军1
1.山东省农业科学院生物技术研究中心,山东 济南,2501002.鱼台县林业局,山东 鱼台,272300
摘要:脂肪氧合酶(lipoxygenases,LOX)是生物体内一种重要的双加氧酶,其在植物发育以及响应生物和非生物胁迫时发挥重要作用。本研究从 Arachis duranensis 和 Arachis ipaёnsis 两个野生花生基因组中各鉴定出18个 LOX 基因,分别命名为 AdLOX1~18和 AiLOX1~18。在 AdLOX5、AdLOX7、AiLOX8和 AiLOX18基因的CDS 序列中发现提前终止翻译的终止密码子,而 AiLOX9基因的 CDS 序列过短,推测这些基因可能是假基因。染色体定位结果显示,AdLOX 和 AiLOX 基因主要分布在2、3、6、8、9和10号染色体上,且其直系同源基因分布在两套染色体相同或相近的位置。通过分析 AdLOX 和 AiLOX 基因与已知功能 LOX 基因的亲缘关系发现,Ad-LOX6、AdLOX9、AdLOX11、AdLOX12、AdLOX17、AiLOX1、AiLOX4、AiLOX6、AiLOX16和 AiLOX17基因可能参与花生的抗病过程,启动子分析结果也支持这一结论。基因选择压力研究表明,AdLOX 和 AiLOX 基因在进化历程中受到纯化选择。
关键词:野生花生LOX 基因家族抗病系统发育选择压力
分类号:S656.201(瓜果园艺)
资助基金:国家高技术研究发展计划(863计划)(2013AA102602)
论文发表日期:2015-01-01
在线出版日期:2026-05-22(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:7( 1-7 )
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山东农业科学

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CSTPCD
ISSN:1001-4942
年,卷(期):2015,(10)
所属栏目:生物技术?遗传育种?种质资源