烟草电压依赖阴离子通道 NtVDAC1.1的电子克隆及生物信息学分析
武兆云
张小全
杨铁钊
王红
1.河南农业大学烟草学院,河南 郑州,4500022.河南农业大学烟草学院,河南 郑州,4500023.河南农业大学烟草学院,河南 郑州,4500024.河南农业大学烟草学院,河南 郑州,450002
摘要:为研究电压依赖阴离子通道(VDAC)基因在烟草根系分泌有机酸的作用,进而为了解该基因的功能和应用提供基础,以拟南芥 AtVDAC1(NM_110994)为搜索序列,应用电子克隆技术得到一条烟草 VDAC基因全长 cDNA,命名为 NtVDAC1.1。生物信息学分析表明该基因全长为1018 bp,有着完整的开放阅读框,编码276个氨基酸。进化关系及同源性分析表明,NtVDAC1.1与其他物种的 VDAC 有着较高的相似性,其中与茄科植物马铃薯三个膜孔蛋白有着很高的一致性(0.768~0.902)。功能分析显示,NtVDAC1.1为膜孔蛋白,参与了阴离子的转运、阴离子转运调节和跨膜运输。二级和四级结构分析均表明,NtVDAC1.1含有α-螺旋和β-折叠。氨基酸位点分析表明,该蛋白具有多种类型的修饰位点,其中的磷酸化位点说明该基因与信号转导有关,对阴离子通道活性具有调节作用。
关键词:烟草电压依赖阴离子通道基因克隆生物信息学分析
分类号:S572(农作物)Q781(基因工程(遗传工程))
资助基金:中国烟草总公司特色优质烟叶开发重大专项(Ts-01-2011003)
论文发表日期:2015-11-01
在线出版日期:2026-05-22(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:7( 5-11 )
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山东农业科学

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CSTPCD
ISSN:1001-4942
年,卷(期):2015,(11)
所属栏目:生物技术?遗传育种?种质资源