甘蓝 GS －Elong 位点基因的预测与分析
宋佳
王珏
刘蕾
王辉
1.青岛农业大学园艺学院,山东 青岛,2661092.青岛农业大学园艺学院,山东 青岛,2661093.青岛农业大学园艺学院,山东 青岛,2661094.青岛农业大学园艺学院,山东 青岛,266109
摘要：以拟南芥中控制硫苷生物合成相关基因家族 GS －Elong 的全长 CDS 及蛋白序列为参考序列，在甘蓝（Brassica oleracea L．）基因组数据库中进行 BLASTN 和 BLASTP 检索，得到具备 Score≥100、E －value≤10－10和 Coverage ≥70％条件的甘蓝注释基因作为拟南芥 GS －Elong 位点基因的候选同源基因，并进一步对其进行同源性和基因结构比较及聚类分析。结果显示，在甘蓝 GS －Elong 位点发现4个旁系同源基因（Bol020647、Bol017070、Bol037823和 Bol017071）。甘蓝和拟南芥 GS －Elong 位点同源基因在核酸水平上的一致性为66．1％～84．3％；甘蓝4个旁系同源基因间的一致性在62．0％～83．7％之间。甘蓝和拟南芥 GS －Elong 位点基因在外显子数目、大小方面高度一致，但 Bol017071和 Bol037823分别较拟南芥 GS －Elong 位点基因少3个和1个外显子。系统进化及共线性分析初步确定，甘蓝中存在2个 BoMAM1（Bol017070和Bol020647）和2个 BoMAM3（Bol017071和 Bol037823）。
关键词：十字花科植物甘蓝硫代葡萄糖苷GS-Elong
分类号：S635(蔬菜园艺)Q781(基因工程（遗传工程）)
资助基金：山东省现代农业产业技术体系项目(SDAIT －02－022－02)青岛市应用基础研究计划项目(14－2－4－112－jch)青岛市民生计划项目(13－1－3－3－nsh)
论文发表日期：2016-01-01
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 5-8 )
英文信息