三个小麦防御素基因的克隆及序列分析
史灵敏1
张斌2
丁汉凤3
李娜娜3
高文伟4
彭振英1
1.新疆农业大学农学院,新疆 乌鲁木齐 830000; 山东省农业科学院生物技术研究中心/山东省作物遗传改良与生态生理重点实验室,山东 济南 2501002.山东省农业科学院生物技术研究中心/山东省作物遗传改良与生态生理重点实验室,山东 济南,2501003.山东省农作物种质资源中心,山东 济南,2501004.新疆农业大学农学院,新疆 乌鲁木齐,830000
摘要:本试验从济麦22幼叶中克隆得到三个小麦防御素基因 TaPDF(Triticum aestivum defensin),分别命名为 TaPDF32、TaPDF33和 TaPDF34(GenBank 登录号分别为 BT009185、BT009167和 BT009022)。序列分析发现,三个防御素基因各自含有一个长度为243、249 bp 和225 bp 的开放阅读框(open reading frame, ORF),依次编码长度为80、82个和74个氨基酸的蛋白。成熟蛋白的分子量均约为5.5 kD,等电点均大于7,含有8个保守的 Cys 残基。保守结构域分析发现,TaPDF32含有一个γ-硫堇功能结构域,TaPDF33和 TaP-DF34均含有一个 Knot1功能结构域,两者均是植物防御素的典型结构域,因此这三个 TaPDF 属于典型的植物防御素蛋白。SWISS -MODEL 在线软件分析表明,三个 TaPDF 的三级结构均由三股反平行的β-折叠和一个α-螺旋组成。系统进化分析表明,TaPDF32、TaPDF33的氨基酸序列与玉米、粟米的防御素相似性较高,而TaPDF34与大豆的防御素相似性较高,但均与已经报道的小麦防御素相似性较低,表明 TaPDF32、TaPDF33和TaPDF34是小麦三个新的防御素蛋白。荧光定量 RT -PCR 分析发现,TaPDF32、TaPDF33基因在小麦叶片中表达量最高,种子次之,根中最低;TaPDF34基因在叶、种子和根中的表达量基本相同。
关键词:小麦植物防御素基因克隆序列分析组织特异性表达
分类号:S512.101(禾谷类作物)
资助基金:“十二五”国家科技计划农村领域项目(2013BAD01B02-13-4)
论文发表日期:2016-10-31
在线出版日期:2026-05-22(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:8( 1-8 )
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山东农业科学

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CSTPCD
ISSN:1001-4942
年,卷(期):2016,48(11)
所属栏目:生物技术?遗传育种?种质资源