花生 Clp 家族成员的筛选、聚类和盐胁迫响应分析
郑春花1
孔祥远2
陈冠旭2
隋炯明2
乔利仙2
王晶珊2
赵春梅2
1.青岛农业大学图书馆,山东 青岛,2661092.青岛农业大学生命科学学院,山东 青岛,266109
摘要:Clp 蛋白酶是一种 ATP 依赖的丝氨酸型蛋白酶,广泛存在于原核和真核生物中,在生物抗逆胁迫中发挥重要作用。为分析花生中 Clp 基因的情况,我们构建了花生叶片转录组数据库,通过生物信息学手段鉴定出28个 Clp 基因,分别位于花生 A 组野生种的9条染色体上;聚类分析表明,花生的28个 Clp 基因分别聚到已报道的 ClpB、C、D、X、P、R 和 S 7个亚类中。利用花生耐盐突变体(S2)和对照(S4)构建了盐胁迫处理前后各时间段的表达谱数据,进行 Clp 基因盐胁迫表达分析,结果表明16个 Clp 基因在 S2和(或)S4中受盐胁迫诱导表达。该研究为花生 Clp 基因的功能研究与利用奠定基础。
关键词:花生Clp 基因RNA 测序盐胁迫
分类号:S565.203.53(经济作物)
资助基金:国家自然科学基金(31571705)国家自然科学基金(31301356)国家自然科学基金(31471542)山东省科技发展计划(2014GNC110002)
论文发表日期:2016-11-30
在线出版日期:2026-05-22(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:5( 1-5 )
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