石榴果皮POD基因的克隆与序列分析
冯立娟1
焦其庆1
尹燕雷1
杨雪梅1
程云2
1.山东省果树研究所/山东省设施果树工程技术研究中心,山东泰安,2710002.聊城市林业局,山东聊城,252000
摘要：本研究以‘泰山红’石榴果实为试材,利用RT-PCR和RACE技术克隆果皮中POD基因cDNA片段,利用BLAST和ORF Finder分析其核苷酸序列,并利用ProtParam、SPOMA、DANMAN等软件分析其氨基酸序列.结果表明,克隆得到1 092 bp的cDNA片段,该基因含828 bp的CDS序列,编码276个氨基酸.该基因核苷酸序列与烟草、茜草、花生二倍体杂生种和潘那利番茄等植物的相似性分别为77％、77％、76％和76％;氨基酸序列与荔枝、克莱门柚、苹果和白梨的相似性分别为89％、87％、84％和84％;GenBank登录号为KY129694.预测蛋白质理论分子量为30 582.59 D,等电点(pI)为8.83,具有过氧化物酶完整的保守结构域,含有Cd00693和C100196两个保守功能域,为亲水性蛋白;蛋白质二级结构主要由无规则卷曲(38.41％)、α-螺旋(37.68％)、延伸链(13.77％)和β-转角(10.14％)组成.该研究结果为揭示石榴果实褐变机理奠定了理论基础.
关键词：石榴POD基因RT-PCR克隆序列分析
分类号：S665.4(果树园艺)
资助基金：山东省自然科学基金(ZR2015YL056)山东省自然科学基金(ZR2014YL022)山东省星火科技示范项目(2015XH002)
论文发表日期：2017-01-01
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 16-20 )
英文信息