洋葱AcPME基因的克隆及序列分析
孙亚玲1
陈立1
孙雨晴2
杨妍妍3
吴雄3
曹辰兴4
霍雨猛3
1.山东农业大学园艺科学与工程学院,山东 泰安 271018;山东省农业科学院蔬菜花卉研究所/山东省设施蔬菜 生物学重点实验室/国家蔬菜改良中心山东分中心,山东 济南 2501002.山东省农业科学院蔬菜花卉研究所/山东省设施蔬菜 生物学重点实验室/国家蔬菜改良中心山东分中心,山东 济南 250100;吉林农业大学园艺学院,吉林 长春 1301183.山东省农业科学院蔬菜花卉研究所/山东省设施蔬菜 生物学重点实验室/国家蔬菜改良中心山东分中心,山东 济南,2501004.山东农业大学园艺科学与工程学院,山东 泰安,271018
摘要：以洋葱花蕾为试材,通过RACE试验获得了AcPME基因的全长cDNA序列,GenBank登录号为JF913196.1.该基因DNA序列包含2 786个碱基,4个外显子,3个内含子,cDNA序列长度为2 228 bp,编码序列长度为2 001 bp,编码666个氨基酸.生物信息学分析显示AcPME蛋白存在明显的信号肽和跨膜区域(SP/TM)、PMEI结构域和PME结构域,在PME家族分类中属于第Ⅰ类,即含有一个长的N末端前区域(PRO-region).氨基酸同源比对与系统进化分析表明,AcPME蛋白与水稻、玉米、高粱等单子叶植物的同源蛋白具有较高的一致性.三维结构模式图显示该蛋白具有一个明显的凹沟,4个果胶结合位点氨基酸残基(T423、Q453、R565和W567),2个活性位点氨基酸残基(D476和D497).本研究为洋葱AcPME基因的结构域蛋白互作及功能研究奠定了基础.
关键词：洋葱果胶甲酯酶(PME)克隆序列分析
分类号：S633.201(蔬菜园艺)
资助基金：国家自然科学基金(31201635)国家自然科学基金(31301786)国家自然科学基金(31672165)
论文发表日期：2017-01-01
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 7-12,25 )
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