中间偃麦草TiAP1基因的克隆及生物信息学分析
田秋菊
宋静
杨艳琳
许田
王洪刚
封德顺
1.山东农业大学农学院/作物生物学国家重点实验室,山东泰安,2710182.山东农业大学农学院/作物生物学国家重点实验室,山东泰安,2710183.山东农业大学农学院/作物生物学国家重点实验室,山东泰安,2710184.山东农业大学农学院/作物生物学国家重点实验室,山东泰安,2710185.山东农业大学农学院/作物生物学国家重点实验室,山东泰安,2710186.山东农业大学农学院/作物生物学国家重点实验室,山东泰安,271018
摘要：本研究从烟农15和中间偃麦草杂交所得的小偃麦异附加系SN6306中克隆得到TiAP1基因的全长序列,该序列全长1 272 bp,预测编码423个氨基酸.通过BlastP分析,发现其属于天冬氨酸蛋白酶家族.生物信息学分析发现,TiAP1蛋白含有信号肽且位于第16和17个氨基酸之间,同时含有两个木聚糖酶抑制剂结构域,分别位于该蛋白的N端和C端.此外,通过TMHMM预测,发现该蛋白无跨膜螺旋结构,因此是胞外蛋白.为了检测基因的亲缘关系,构建系统进化树,发现TiAP1基因与乌拉尔图小麦以及粗山羊草相应基因有较近的亲缘关系.上述结果为研究TiAP1基因的功能奠定了基础.
关键词：小偃麦异附加系TiAP1基因克隆生物信息学分析白粉病
分类号：S512.901(禾谷类作物)
资助基金：国家重点研发计划(2016YFD0102000)国家自然科学基金(31171552)
论文发表日期：2017-10-01
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 1-9 )
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