花生FAD基因家族的全基因组鉴定与表达模式分析
阮建1
单雷1
李新国1
郭峰1
孟静静1
万书波2
彭振英1
1.山东省农业科学院生物技术研究中心/山东省作物遗传改良与生态生理重点实验室,山东 济南,2501002.山东省农业科学院,山东 济南,250100
摘要：脂肪酸去饱和酶(FAD)是合成不饱和脂肪酸的关键酶,在植物维持各项生命活动、应对生物与非生物胁迫方面具有重要作用.本研究对花生基因组中的FAD基因家族进行鉴定与生物信息学分析,并利用花生转录组数据对花生FAD(AhFAD)基因的表达模式及可变剪接形式进行分析.结果显示,在花生基因组中共有31 个AhFAD基因,分为6类,AhSAD基因亚家族有12条序列,AhFAD2有6 条序列,AhFAD3有4条序列,AhFAD4/5有3条序列,AhFAD6有2条序列,AhFAD7/8有4条序列.聚类分析表明,AhFAD有两大分支:游离AhSAD分支和膜结合AhFAD分支;膜结合AhFAD分支中AhFAD4/5 起源最早,ω-3 AhFAD由ω-6 AhFAD进化而来;单双子叶聚类于不同分支.表达模式分析表明,AhSAD、AhFAD2 和AhFAD3 在种子中表达水平较高,AhFAD4/5、AhFAD6、AhFAD7/8在叶中表达量最高.可变剪接分析表明,AhFAD亚家族之间可变剪接形式差异明显,其中有12个AhFAD基因发生了可变剪接.TTS和TSS是发生最多的可变剪接事件,其次是IR,最少的是AE和ES.
关键词：花生脂肪酸去饱和酶(FAD)生物信息学分析表达模式可变剪接
分类号：S565.2(经济作物)Q7(分子生物学)
资助基金：国家自然科学基金(31470349)国家自然科学基金(31571605)国家科技支撑计划(2014BAD11B04)国家国际科技合作专项基金(2015DFA31190)现代农业产业技术体系建设专项(CARS-13)
论文发表日期：2018-06-02
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 1-9 )
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