花生DGAT基因家族的生物信息学分析
郑玲1
单雷1
李新国1
郭峰1
孟静静1
万书波2
彭振英1
1.山东省农业科学院生物技术研究中心/山东省作物遗传改良与生态生理重点实验室,山东 济南,2501002.山东省农业科学院,山东 济南,250100
摘要:含油量是花生最重要的品质性状之一.花生油的主要成分是三酰甘油(TAG),二酰甘油酰基转移酶(DGAT)是催化合成TAG的关键酶类,其活性高低与含油量呈正相关.本研究利用生物信息学方法对花生DGAT(AhDGAT)基因家族的进化、基因结构特点、表达模式以及可变剪接等进行了分析.进化分析结果显示, AhDGAT1、AhDGAT2和AhDGAT3亲缘关系较近,与AhWSD/DGAT的亲缘关系稍远.AhDGAT1 具有17 ~18个外显子,AhDGAT2具有7 ~9 个外显子,AhDGAT3 具有2 ~3 个外显子,而AhWSD/DGAT具有3 ~6 个外显子.AhDGAT1 的跨膜区数目为7 ~1 1 个,AhDGAT2 和AhWSD/DGAT为0 ~2 个,AhDGAT3 没有跨膜结构.另外,4个亚家族均具有自己特有的保守结构域和表达模式.AhDGAT1 和AhDGAT2在种子中表达量较高,而AhDGAT3和AhWSD/DGAT在根和叶中的表达量较高.AhDGAT1的可变剪接形式最多,其次为AhWSD/DGAT.花生的4个AhDGAT亚家族具有不同的特点,表明它们可能在进化中具有不同的祖先.
关键词:花生二酰甘油酰基转移酶(DGAT)进化表达模式
分类号:S565.2(经济作物)Q7(分子生物学)
资助基金:国家自然科学基金(31571605)国家科技支撑计划(2014BAD11B04)国家国际科技合作专项基金(2015DFA31190)现代农业产业技术体系建设专项(CARS-13)
论文发表日期:2018-06-02
在线出版日期:2026-05-22(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:9( 10-18 )
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山东农业科学

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CSTPCD
ISSN:1001-4942
年,卷(期):2018,50(6)
所属栏目:生物技术·遗传育种·种质资源