花生FAT基因家族的全基因组分析
张会1
单雷1
李新国1
郭峰1
孟静静1
万书波2
彭振英1
1.山东省农业科学院生物技术研究中心/山东省作物遗传改良与生态生理重点实验室,山东 济南,2501002.山东省农业科学院,山东 济南,250100
摘要:酰基-ACP硫酯酶(fatty acyl-ACP thioesterase,FAT)是控制植物种子油脂合成的关键酶,根据其氨基酸序列和底物特异性不同可分为FATA和FATB两类.为了更深入了解花生FAT(AhFAT)的特点与功能,本研究对AhFAT家族基因进行了全基因组生物信息学分析.在花生基因组中共有20个FAT基因,不均匀分布在2个基因组的12条染色体上.20个AhFATs可以分为AhFATA和AhFATB两个亚家族,AhFATA亚家族有2个基因,AhFATB亚家族有18个基因.AhFATA家族基因具有6 或8个外显子,AhFATB家族基因结构较为复杂,外显子数目5 ~8个;AhFATs都不具有跨膜结构域但是都具有保守的Acyl-ACP_TE结构域.对AhFAT家族基因进行可变剪接分析,发现只有少数发生了可变剪接,且具有组织特异性.对AhFATs表达模式分析的结果显示,AhFATAs和AhFATBs都在种子发育后期表达量较高.
关键词:花生酰基载体蛋白硫酯酶(FAT)可变剪接表达模式
分类号:S565.2(经济作物)Q7(分子生物学)
资助基金:国家自然科学基金(31571605)国家科技支撑计划(2014BAD11B04)国家国际科技合作专项基金(2015DFA31190)现代农业产业技术体系建设专项(CARS-13)
论文发表日期:2018-06-02
在线出版日期:2026-05-22(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:8( 19-26 )
英文信息
