石榴查尔酮合成酶蛋白的生物信息学分析
冯立娟1
尹燕雷1
杨雪梅1
唐海霞1
李英朋2
鹿英3
1.山东省果树研究所,山东泰安,2710002.冠县店子乡林业站,山东冠县,2525253.肥城市石横镇林果站,山东肥城,271612
摘要：本研究用生物信息学方法对石榴及其他19个物种CHS蛋白的系统进化和motif元件进行分析,重点预测分析石榴、巨桉和拟南芥CHS蛋白的理化性质、氨基酸组成、磷酸化位点和二级结构.结果 表明,石榴与巨桉亲缘关系最近,与拟南芥最远.石榴、巨桉和拟南芥CHS蛋白由20种氨基酸组成,数量和比例存在差异,石榴和拟南芥中亮氨酸数量最多,巨桉中丙氨酸最多;存在丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸3个磷酸化结合位点,多数发生在苏氨酸和丝氨酸位置上;二级结构由α-螺旋、延伸链、无规则卷曲和β-转角构成,α-螺旋和无规则卷曲占比较高.在20个物种CHS蛋白的motif元件中,石榴CHS蛋白motif数量和位置与巨桉完全一致,与大多数物种相似,与拟南芥差异较大.本研究结果可为深入研究CHS生物学功能及其调控石榴果实呈色的机理提供理论依据.
关键词：石榴花青苷查尔酮合成酶生物信息学
分类号：S665.403(果树园艺)
资助基金：山东省重点研发计划项目(2018GNC111009)创新工程项目(CXGC2018E22)山东省农业良种工程项目(2017LZN023)
论文发表日期：2019-01-01
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 7-12 )
英文信息