大白菜GID1家族基因鉴定及表达模式分析
宋晴晴1
张慧敏1
张烨2
张一卉1
李景娟3
李化银3
贺立龙3
王凤德3
高建伟3
1.山东省农业科学院蔬菜花卉研究所/山东省设施蔬菜生物学重点实验室/国家蔬菜改良中心山东分中心,山东 济南 250100;山东师范大学生命科学学院,山东 济南 2500142.山东省农业科学院蔬菜花卉研究所/山东省设施蔬菜生物学重点实验室/国家蔬菜改良中心山东分中心,山东 济南 250100;黄山学院生命与环境科学学院,安徽 黄山 2450413.山东省农业科学院蔬菜花卉研究所/山东省设施蔬菜生物学重点实验室/国家蔬菜改良中心山东分中心,山东 济南 250100
摘要:GID1蛋白是赤霉素信号转导过程中的重要受体,在调控植物生长发育过程中发挥重要作用.本研究采用生物信息学分析方法对大白菜基因组中GID1家族基因进行鉴定,并对该基因结构、染色体分布、系统进化以及表达模式等进行分析.结果表明,大白菜基因组中含有5个GID1家族成员,分别位于4、5、6、7、9号染色体上,各成员都只含有1个内含子.系统进化结果显示,单子叶和双子叶植物的GID1蛋白明显处于两个不同分支,大白菜GID1家族成员与拟南芥GID1具有更近的亲缘关系.通过表达模式以及启动子顺式响应元件分析发现,大白菜GID1基因不仅参与生长发育调控还可能参与对不同环境因子的响应过程.
关键词:大白菜GID1基因生物信息学分析表达模式分析
分类号:S634.103(蔬菜园艺)Q78(基因工程(遗传工程))
资助基金:泰山学者青年专家计划(No.tsqn201909167)山东省重点研发计划项目(2019GNC106014)山东省重点研发计划项目(2019GHZ014)山东省现代农业产业技术体系项目(SDAIT-05-04)山东省农业良种工程项目(2019LZGC0060101)国家大宗蔬菜产业技术体系项目(CARS-25-G-24)黄山学院校级人才启动项目(2019xkjq011)
论文发表日期:2020-03-28
在线出版日期:2026-05-22(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:7( 1-7 )
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山东农业科学

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CSTPCD
ISSN:1001-4942
年,卷(期):2020,52(3)
所属栏目:生物技术·遗传育种·种质资源