花椰菜苗期黑腐病抗、感品种转录组差异表达分析
姚玉荣1
霍建飞2
郝永娟2
贲海燕2
王万立2
1.天津科润农业科技股份有限公司/蔬菜种质创新国家重点实验室,天津 300384;天津市植物保护研究所,天津 3003842.天津科润农业科技股份有限公司/蔬菜种质创新国家重点实验室,天津 300384
摘要：为研究花椰菜抗黑腐病的分子机制,本试验利用Illumina测序平台的RNA-Seq技术对花椰菜黑腐病感病品种Y1-2和抗病品种EC-247接种黑腐病菌5 d后的样本进行高通量转录组分析,采用RSEM软件计算基因表达量,并在此基础上筛选两组样本间的差异表达基因.结果显示,抗、感品种间差异表达基因共3195个,其中上调表达基因1424个,下调表达基因1771个.通过GO和KEGG进行基因功能显著性富集分析发现,差异表达基因主要富集于苯丙烷类代谢、次级代谢产物合成、逆境响应、MAPK信号通路等途径.本研究结果可为解析花椰菜与黑腐病互作机制、挖掘黑腐病抗病基因提供参考.
关键词：花椰菜黑腐病转录组差异表达基因
分类号：S635.301(蔬菜园艺)
资助基金：国家重点实验室开放基金(201802)天津市自然科学基金(18JCQNJC14900)
论文发表日期：2020-07-28
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 1-6 )
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