基于高通量测序的菟丝子生防菌"鲁保一号"转录组学研究
李健
李美
高兴祥
房锋
1.山东省农业科学院植物保护研究所,山东 济南 2501002.山东省农业科学院植物保护研究所,山东 济南 2501003.山东省农业科学院植物保护研究所,山东 济南 2501004.山东省农业科学院植物保护研究所,山东 济南 250100
摘要："鲁保一号"是对菟丝子具有良好防效的生防菌,由于其致病力退化和分子遗传信息的匮乏,对于该菌的深入研究受到了限制.为进一步挖掘"鲁保一号"菌株的遗传资源,获得致病力退化相关的功能基因,本研究运用新一代高通量测序技术(Illumina Hiseq 2500)对"鲁保一号"菌株进行转录组测序分析.结果表明,获得了总长度为31126662 bp的unigene序列信息;对序列进行组装拼接后获得17031条单基因簇(uni-gene),平均长度为1827.65 bp.序列同源性比较表明,86.04％的序列与已知炭疽菌序列有不同程度的同源性.将unigene与KOG数据库进行比对,根据其功能大致分为25类,其中注释最多的是一般功能预测类基因,其次是翻译后修饰、蛋白折叠和分子伴侣类基因.针对测序得到的基因信息,筛选获得6个CDC相关基因,分为3个亚组.本研究通过对"鲁保一号"菌株进行高通量测序,获得了丰富的转录组信息,为新基因的挖掘和基因组学的研究奠定了基础.
关键词：鲁保一号菟丝子转录组高通量测序
分类号：S476.1(各种防治方法)
资助基金：山东省重点研发计划项目(2019GSF107076)农业科技创新工程项目(CXGC2018E04)农业科技创新工程项目(CXGC2016B11)
论文发表日期：2021-01-28
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 26-31 )
英文信息