基于GBS技术的233份大蒜种质资源群体进化分析
管梦娇
谢亚楠
顾启玉
孙秀东
高荣广
山东农业大学园艺科学与工程学院,山东 泰安 271018
摘要：本试验利用233份大蒜的自然群体资料,主要使用简化基因组测序(GBS)技术,得到高质量的有效数据量为1486.5896 Gb,平均每个样本6.3802 Gb,共获得高质量的SNPs位点2036116个,较均匀地分布在8条染色体上.基于获得的SNP标记进行主成分分析(PCA)与系统进化树分析,PCA将大蒜群体划分为4大类,系统进化树将大蒜群体划分为8个亚群,将8个亚群用不同颜色在PCA图中呈现,两者结果基本一致,表明大蒜种质间亲缘关系主要受地理起源影响较大,另外也与各地大蒜种质资源交流频繁和气候环境等有一定关系.本研究结果可为大蒜种质资源的收集和保护提供依据,为发掘优良种质、优良基因和大蒜性状分子改良提供资源.
关键词：大蒜简化基因组测序(GBS)遗传多样性群体进化
分类号：S633.4(蔬菜园艺)
资助基金：山东省自然科学基金面上项目(AsHAP5;ZR2016CM33)
论文发表日期：2021-04-28
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 12-18,22 )
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