7个桑树AP2/ERF转录因子的生物信息学及表达分析
董亚茹
李茹霞
赵东晓
耿兵
孙景诗
李云芝
王照红
山东省蚕业研究所,山东 烟台 264002
摘要:AP2/ERF类转录因子是植物所特有的一类转录因子家族,在植物的生长发育及响应非生物胁迫中发挥着重要作用.为发掘桑树AP2/ERF类转录因子的成员及其功能,从桂桑优12中克隆到7个AP2/ERF转录因子,命名为MnAP2/ERF1~MnAP2/ERF7.生物信息学分析结果表明,这7个AP2/ERF蛋白都属于不稳定蛋白,且均属于亲水性蛋白,二级结构以无规则卷曲为主,亚细胞定位显示主要位于细胞核中.氨基酸序列比对及进化树分析发现,这7个AP2/ERF转录因子均含有1个保守AP2结构域,其中MnAP2/ERF1~MnAP2/ERF4属于ERF亚家族,MnAP2/ERF5~MnAP2/ERF7属于DREB亚家族.荧光定量分析显示,NaCl、PEG6000、水淹胁迫可诱导7个桑树AP2/ERF基因上调表达,其中MnAP2/ERF3、MnAP2/ERF5、MnAP2/ERF6分别响应水淹、干旱和盐胁迫,说明桑树AP2/ERF转录因子的表达与逆境胁迫响应之间有密切的联系.本研究结果可为进一步揭示AP2/ERF转录因子调控桑树生长发育及逆境胁迫的机理奠定基础.
关键词:桑树AP2/ERF转录因子生物信息学分析基因表达非生物胁迫
分类号:S888.3(蚕桑)Q786(基因工程(遗传工程))
资助基金:山东省自然科学基金(ZR2019PC043)烟台市科技创新发展计划项目(2021XDHZ057)山东省现代农业产业技术体系蚕桑产业创新团队项目(SDAIT-18-03)山东省科技特派员行动计划项目(2020KJTPY070)
论文发表日期:2022-01-28
在线出版日期:2026-05-22(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:7( 7-13 )
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山东农业科学

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CSTPCD
ISSN:1001-4942
年,卷(期):2022,54(1)
所属栏目:生物技术·遗传育种·种质资源