谷子NCED3基因克隆及生物信息学和表达模式分析
王艳珂1
黎飞飞2
陈二影2
杨延兵2
管延安2
高文伟1
秦岭2
1.新疆农业大学农学院,新疆 乌鲁木齐 8300002.山东省农业科学院作物研究所,山东 济南 250100
摘要：脱落酸(ABA)在植物生长发育中起着重要作用,9-顺式-环氧类胡萝卜素双加氧酶(NCED)是ABA合成过程中的关键限速酶,关于谷子(Setaria italica)NCED基因研究的报道较少.本研究以济谷22为材料,通过RT-PCR克隆得到SiNCED3,生物信息学分析结果表明,其cDNA全长1836 bp,编码611个氨基酸;SiNCED3蛋白相对分子质量为66.36 kD,等电点为6.15,为稳定蛋白,无信号肽,亚细胞定位预测定位于叶绿体中,含一个NCED基因家族典型结构域RPE65,二级结构主要由无规则卷曲和延伸链构成;启动子顺式作用元件分析表明其受光、ABA、生长素等调控.通过qRT-PCR发现,SiNCED3在谷子根、茎、叶、叶鞘、穗等组织中均有表达,根中的表达量最高;干旱、低温以及盐胁迫都可以不同程度地诱导SiNCED3在谷子幼苗中的表达,表明该基因可能参与调控谷子对不同逆境的响应.
关键词：谷子SiNCED3基因克隆生物信息学分析表达分析
分类号：S515:Q781(禾谷类作物)
资助基金：现代农业产业技术体系(CARS-06-13.5-A19)山东省农业良种工程项目(2021LZGC006)
论文发表日期：2022-09-28
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 1-7 )
英文信息