白菜TLP基因家族鉴定及表达分析
王紫雯
陈雨
吴晓宇
赵玉梅
任鑫如
吕金枝
李嘉利
段巧红
黄家保
山东农业大学园艺科学与工程学院/作物生物学国家重点实验室,山东 泰安 271018
摘要:已有研究表明TLP(Tubby-like protein)蛋白在植物应对非生物胁迫方面具有重要作用.本研究利用生物信息学方法在白菜中鉴定得到14个TLP家族基因,并对其理化性质、基因结构特征、蛋白保守性、系统进化关系、组织表达模式及对盐胁迫的响应情况进行了初步分析.结果表明,该家族基因分布在白菜10条染色体中的7条.蛋白分子量介于38735.69~52747.34 D,等电点介于9.16~9.88.基因结构分析表明,有1个TLP基因含有9个CDS,绝大多数基因CDS为4~5个.亚细胞定位预测结果表明,该基因家族成员主要定位在细胞核、线粒体和细胞质基质.启动子顺式作用元件分析表明,该基因家族成员含有包括光响应元件、脱落酸应答元件、厌氧反应应答元件在内的大量逆境胁迫应答元件.组织特异性表达分析发现大多数BrTLPs在花中表达量较高,在茎、叶片和果荚中的表达量与根相似;绝大多数白菜TLP基因对盐胁迫都有不同程度的响应,其中BrTLP14对盐胁迫反应最强烈,暗示该基因可能在白菜响应盐胁迫过程中发挥重要作用.
关键词:白菜TLP基因家族表达分析
分类号:S634.1(蔬菜园艺)Q786(基因工程(遗传工程))
资助基金:山东省自然科学基金重点项目(BrACS6;ZR2020KC017)
论文发表日期:2023-01-28
在线出版日期:2026-05-22(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:10( 22-31 )
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山东农业科学

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CSTPCD
ISSN:1001-4942
年,卷(期):2023,55(1)
所属栏目:生物技术·遗传育种·种质资源