两个菜心CBL基因的克隆、生物信息学分析及其表达特性分析
朱云娜1
符质2
冯慧敏1
王斌1
沈雪晴2
汤婉君2
刘建国1
1.广东省粤北食药资源利用与保护重点实验室,广东 韶关 512005;韶关学院英东生物与农业学院,广东 韶关 5120052.韶关学院英东生物与农业学院,广东 韶关 512005
摘要：本研究以'油绿 501'菜心(Brassica campestris L.ssp.chinensis var.utilis Tsen et Lee)为材料,采用同源克隆方法对其CBL1、CBL9 基因进行克隆,运用DNAMAN和MEGA软件对其编码蛋白序列进行同源性分析和系统进化分析,并利用qRT-PCR技术分析二者在菜心组织中及不同氮素形态条件下的表达模式.结果表明:菜心CBL1、CBL9 基因的cDNA全长均为 642 bp,编码 213 个氨基酸,分别命名为BcCBL1 和BcCBL9,具有CBL蛋白结合Ca2+所必需的EF-hand型结构域(EFh).BcCBL1、BcCBL9 编码的氨基酸序列与拟南芥(Arabi-dopsis thaliana)、大白菜(Brassica rapa)等物种的同源性均达 95%以上;二者分别与大白菜的BrCBL1、BrCBL9遗传距离最近,并与拟南芥AtCBL1、AtCBL9 共同聚类为一支.BcCBL1 和BcCBL9 在菜心各组织器官中均有表达,前者在菜心叶片中表达水平较高,后者在菜心荚果等组织中表达水平较高;两者表达受氮素形态及水平影响,前者在低浓度NO3- 或NH4+ 处理后上调表达,后者表达随NH4+浓度增加而上调表达.该研究结果可为进一步研究菜心CBL1 和CBL9 在氮素吸收利用过程中的功能及其调控机制提供一定理论基础.
关键词：菜心氮素形态类钙调磷酸酶B亚基蛋白基因克隆生物信息学分析表达分析
分类号：S634.9:Q781(蔬菜园艺)
资助基金：国家自然科学基金(32202465)广东省自然科学基金项目(2019A1515011680)韶关市科技攻关项目(200810224537535)韶关学院博士科研启动项目(99000613)
论文发表日期：2023-07-28
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 1-9 )
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