花生KNOX基因家族的全基因组鉴定及组织表达分析
宋晓峰
鲁成凯
董晓娜
高晓东
孙熙文
付春
潍坊市农业科学院,山东 潍坊 261071
摘要：为研究花生KNOX基因家族在生长发育以及非生物胁迫响应中的功能,本研究采用生物信息学手段在栽培种花生基因组水平上对KNOX基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、基因结构、蛋白质保守结构域、系统进化、启动子顺式作用元件以及组织与逆境下的表达模式进行分析.结果显示:花生基因组中共有 26个KNOX基因家族成员,分布在17条染色体上,绝大多数编码酸性蛋白,均为亲水性蛋白,并全部定位于细胞核.系统发育分析可将花生KNOX家族分为ClassⅠ和ClassⅡ两个亚家族,并进一步分为4个亚组.启动子分析发现一些与生长发育、激素和胁迫响应相关的顺式作用调控元件.全生育期组织表达分析结果显示,ClassⅠ类基因表达组织特异性明显,主要在花、营养茎尖、生殖茎尖、果针等组织中高表达;ClassⅡ类基因时空表达更广泛.在7种非生物胁迫处理下,部分基因表达量变化较大,其中5 个基因响应特定胁迫,RT-qPCR验证了2 个特异性响应PEG胁迫的基因.本研究为进一步探究花生KNOX基因在生长发育、逆境响应中的功能奠定了基础.
关键词：花生KNOX基因家族全基因组鉴定生物信息学分析表达分析
分类号：S565.2:Q781(经济作物)
资助基金：潍坊市科技发展计划项目(2022ZJ1087)现代农业产业技术体系(CARS-13)潍坊市现代种业创新发展项目(2021)
论文发表日期：2023-08-28
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 1-10 )
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