高粱SBP基因家族鉴定及干旱胁迫下的表达模式分析
姜昱雯1
陈满静1
赵应2
任艳1
周棱波1
沈佳奇1
邵明波1
1.贵州省旱粮研究所,贵州 贵阳 5500062.仁怀市农业农村局,贵州 仁怀 564500
摘要:在高等植物中,SQUAMOSA Promoter Binding Protein-Box(SBP)普遍参与植物的生长、开花调控及细胞程序性死亡等过程.本研究对高粱(Sorghum bicolor L.)SBP转录因子家族进行鉴定并进行生物信息学分析,同时利用qRT-PCR对高粱SBP基因在PEG-6000 模拟干旱胁迫下的表达进行分析,以验证其功能.结果表明,从高粱中共鉴定出 19 个SBP成员,除第 8 条染色体外,其他 9 条染色体上均分布有SBP基因;绝大部分SBP蛋白在亚细胞水平定位于细胞核,且均为亲水性蛋白质.系统发育分析结果表明,与水稻类似,这 19 个高粱SBP基因也可分为 3 个亚类,分别含有 7、5、7 个SBP基因;相比于拟南芥,高粱SBP与水稻、玉米的SBP关系更近.启动子顺式作用元件预测结果显示,高粱SBP可能参与了脱落酸、茉莉酸甲酯信号通路,部分成员可能与植物的低温响应、昼夜节律调控有关.qRT-PCR分析结果显示,高粱SBP基因的表达具有组织特异性,有 17 个基因受干旱胁迫诱导上调表达,且随胁迫时间的延长存在差异化表达模式.本研究结果可为后续研究高粱SBP基因的功能提供理论依据.
关键词:高粱SBP基因家族生物信息学分析基因表达干旱胁迫
分类号:S514(禾谷类作物)Q78(基因工程(遗传工程))
论文发表日期:2024-03-28
在线出版日期:2026-05-22(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:10( 1-10 )
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山东农业科学

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ISSN:1001-4942
年,卷(期):2024,56(3)
所属栏目:生物技术·遗传育种·种质资源