烟草糖苷水解酶GH3基因家族鉴定与表达分析
张贞宇1
罗正飞2
杨帅1
顾江南1
尹协1
韦银龙1
聂琼2
1.贵州大学烟草学院/贵州省烟草品质研究重点实验室,贵州 贵阳 5500252.贵州大学农学院,贵州 贵阳 550025
摘要:糖苷水解酶GH3 基因家族在植物的糖代谢和生长发育中起着重要作用,而烟草GH3 基因家族目前尚未见相关鉴定和分析研究报道.本研究采用生物信息学方法在烟草基因组中鉴定GH3 家族基因,并对其在不同组织中及逆境条件下的表达模式进行了分析.结果表明,在普通烟草K326 的基因组中共鉴定出35 个GH3 基因,其中 23 个被定位在 14 条染色体上,存在 6 对共线性基因;GH3 家族蛋白均为热稳定性蛋白,其基因上游启动子区均包含多个激素和胁迫响应元件.转录组数据表明,GH3 家族基因大多数在烟苗茎尖高表达,少部分在根和茎中高表达,表达量受光照时间影响;烟苗受到干旱胁迫后GH3 家族成员都有不同程度的响应.挑选 4 个NtGH3 基因进行qRT-PCR分析,结果表明,NtGH3-5、NtGH3-19、NtGH3-22、NtGH3-26 可能参与响应低温以及ABA处理.这可为深入了解烟草GH3 基因家族及其功能提供依据.
关键词:烟草GH3基因家族糖苷水解酶生物信息学分析表达模式
分类号:S572(农作物)Q781(基因工程(遗传工程))
资助基金:贵州省烟草公司重点研发项目(2022XM07)
论文发表日期:2024-04-28
在线出版日期:2026-05-22(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:11( 9-19 )
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