烟碱转运候选基因NtABCG6L生物信息学及表达特征分析
龙本山1
莫泽君2
张静瑶1
彭丽沙1
段丽丽2
罗家骏1
刘仁祥1
1.贵州大学烟草学院,贵州 贵阳 550025;贵州省烟草品质研究重点实验室,贵州 贵阳 5500252.贵州省烟草品质研究重点实验室,贵州 贵阳 550025
摘要：为预测前期筛选到的可能影响烟草烟碱含量的NtABCG6L基因是否具有转运烟碱功能,本研究采用生物信息学方法对NtABCG6L基因的启动子序列以及编码蛋白的理化性质和结构进行分析,利用软件对烟碱与NtABCG6L蛋白进行分子对接,并分别在烟株打顶 0、7、14、21 d取根、茎、叶测定烟碱含量和NtABCG6L基因的相对表达量,以分析NtABCG6L基因表达量与烟碱转运效率的关系.结果表明,NtABCG6L基因共编码729 个氨基酸;NtABCG6L蛋白分子量为 81.29 kDa,理论pI值为 8.97,含有ABC_transporter-like_ATP-bd、AB-CG_dom、ABC_2_trans结构域,二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成,存在跨膜结构,主要定位在细胞膜上,预测NtABCG6L是一个跨膜转运蛋白.NtABCG6L蛋白与烟碱可以通过氢键结合,结合能为-2.95.Nt-ABCG6L基因主要在烟草根部表达,打顶 14d表达量最高,其表达量与烟碱转运系数呈显著正相关关系,初步推测 NtABCG6L基因参与了烟碱的转运过程.本研究结果可为进一步采用基因编辑技术明确其功能提供依据.
关键词：烟草NtABCG6L基因生物信息学分析烟碱转运基因表达
分类号：S572(农作物)Q786(基因工程（遗传工程）)
资助基金：国家自然科学基金(32060510)贵州省烟草公司基金项目(2022XM02)
论文发表日期：2024-04-28
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 20-27,45 )
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