番茄LeGlyⅠ基因的生物信息学特征与表达模式分析
孙晓辉
张月昌
蒋健
石勇志
孙秀东
山东农业大学园艺科学与工程学院,山东 泰安 271018
摘要:植物在遭受逆境胁迫时会产生过量的甲基乙二醛(MG)等有毒醛类化合物,而乙二醛酶系统能帮助其有效清除过量的MG,其中乙二醛酶Ⅰ(GlyⅠ)是级联反应的第一个酶,在此过程中发挥了重要作用.本研究以野生番茄'Heinz 1706'的幼苗为试材,克隆了番茄LeGlyⅠ基因,并对其生物信息学特征、表达模式以及亚细胞定位进行了分析.结果表明,LeGlyⅠ的CDS序列全长为 489 bp,共编码 162 个氨基酸;LeGlyⅠ蛋白分子式为C798 H1226 N214 O235 S4,分子量为 17 706.05 Da,等电点为 6.51,亲水性平均值为-0.386,不稳定系数为39.32,预测为亲水性稳定蛋白,含有一个VOC-like结构域.LeGlyⅠ的启动子序列中包含多种顺式作用元件,包括无氧诱导必需的顺式作用元件、光响应元件、低温响应元件、干旱响应元件以及茉莉酸甲酯、脱落酸、生长素、赤霉素等激素响应元件.通过qRT-PCR分析发现,LeGlyⅠ基因在番茄的根、茎、叶中均有表达,且在叶中的表达量最高,并且其表达水平受氧化胁迫的影响.亚细胞定位结果显示,LeGlyⅠ蛋白主要在线粒体和细胞核中发挥功能.本研究结果可为深入研究LeGlyⅠ基因在番茄抗逆中的功能及其分子机制提供理论依据.
关键词:LeGlyⅠ基因番茄生物信息学分析氧化胁迫基因表达亚细胞定位
分类号:S641.2(园艺)Q786(基因工程(遗传工程))
资助基金:国家自然科学基金(31772323)
论文发表日期:2024-06-28
在线出版日期:2026-05-22(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:6( 1-6 )
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山东农业科学

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CSTPCD北大核心
ISSN:1001-4942
年,卷(期):2024,56(6)
所属栏目:生物技术·遗传育种·种质资源