王族海棠Alfin-like家族基因的鉴定及盐胁迫下的表达分析
杨艳1
孙瑜1
施伯宁1
田治国1
王飞2
1.常州大学美术与设计学院,江苏 常州 2131592.西北农林科技大学园艺学院,陕西 杨凌 712100
摘要：Alfin-like(AL)转录因子家族对非生物胁迫反应具有重要的调控作用.本研究采用同源比对的方法检索鉴定王族海棠AL转录因子家族基因,系统分析其生物信息学特性,并采用qRT-PCR方法分析其在盐胁迫下的表达模式,以期为揭示AL家族在王族海棠响应盐胁迫中的生理功能提供理论依据.结果表明,从王族海棠基因组中共鉴定出 11 个MdALs基因,分布在 6 条染色体上,分别命名为MdAL1—MdAL11.MdALs转录因子具有高度保守的Alfin结构域和PHD锌指结构域,含 4～10 个内含子;上游启动子区域有大量与植物激素和非生物胁迫响应相关的顺式作用元件,且基因片段复制事件在MdAL基因家族的扩展中起着至关重要的作用.转录组分析显示 MdALs 基因主要在王族海棠生育后期高表达.qRT-PCR 分析进一步表明,MdALs基因在王族海棠遭受盐胁迫下的表达模式不同,盐胁迫下,MdAL3、MdAL4、MdAL6 基因的表达量整体上调,尤其MdAL4 基因,其表达水平随着盐胁迫处理时间的延长呈显著增加趋势.综上,王族海棠AL转录因子家族与植物响应激素变化和非生物胁迫密切相关,尤其是MdAL4 基因,强烈响应盐胁迫,这可为利用基因工程技术改良王族海棠种质奠定基础.
关键词：王族海棠Alfin-like家族基因生物信息学分析功能鉴定盐胁迫基因表达
分类号：S685.99(观赏园艺（花卉和观赏树林）)Q781(基因工程（遗传工程）)
资助基金：国家自然科学基金(31700612)江苏省高校科学研究项目(2019SJA1090)
论文发表日期：2024-06-28
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 16-24 )
英文信息