丹参Remorin基因SmREM1.2的克隆及生物信息学和表达分析
庞雨萌1
刘湘1
董仲春1
王新新2
赵一伍1
赵双双1
1.山东师范大学生命科学学院,山东 济南 2500142.中国中医科学院中药资源中心/道地药材国家重点实验室培育基地,北京 100700
摘要：Remorin蛋白是一类植物特异的寡聚丝状蛋白,定位于细胞膜,介导脂筏微区形成,在植物逆境胁迫应答及植物免疫调节等过程中发挥重要作用.丹参是我国大宗类中药材,广泛用于心脑血管疾病等的治疗.但目前丹参Remorin蛋白的相关研究报道还不多.本研究基于丹参转录组及基因组数据库,克隆得到丹参Remorin基因SmREM1.2,通过生物信息学方法对其氨基酸组成、保守序列、系统进化进行分析,并对其亚细胞定位及在盐胁迫下的表达情况进行分析.结果表明,该基因CDS全长 585 bp,编码 194 个氨基酸残基.SmREM1.2 蛋白为弱酸性不稳定的亲水性蛋白,无信号肽,无跨膜区,含有Remorin_N和Remorin_C保守结构域,二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主;氨基酸序列分析结果显示其C端具有高度保守的coiled-coil模体,属于典型的REM蛋白;系统进化树分析结果表明SmREM1.2 与芡欧鼠尾草(Salvia hispanica)的Remorin蛋白亲缘关系较近.构建pCAMBIA-SmREM1.2-GFP重组载体,利用烟草瞬时转化系统对SmREM1.2 进行亚细胞定位分析,发现该蛋白定位于细胞膜上.通过实时荧光定量PCR分析发现SmREM1.2 受盐胁迫诱导上调表达,推测其在盐胁迫下发挥重要作用.本研究结果可为后期深入探索SmREM1.2 基因的功能及应用提供理论依据.
关键词：丹参SmREM1.2基因基因克隆生物信息学分析表达分析亚细胞定位
分类号：S567.5+3(经济作物)Q781(基因工程（遗传工程）)
资助基金：国家自然科学基金(32070313)山东师范大学大学生创新创业训练计划项目(202110445273)山东师范大学大学生创新创业训练计划项目(202110445140)
论文发表日期：2024-07-28
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 1-7 )
英文信息