葡萄VvLBD35和VvLBD36的生物信息学与表达分析
李颖1
李高青2
高明刚1
许瑞瑞1
1.潍坊学院生物与海洋学院,山东潍坊 2610612.寿光市农业农村局,山东寿光 262700
摘要：LATERAL ORGAN BOUNDARIES DOMAIN(LBD)家族是含有高度保守的LOB结构域的一类植物特有转录因子,参与植物的生长代谢以及多种逆境胁迫应答等过程.本研究通过生物信息学方法对葡萄LBD基因家族中的VvLBD35和VvLBD36进行基因结构和进化关系分析,并利用qRT-PCR技术检测两个基因的组织表达模式以及在干旱、高盐、高温和低温条件下的诱导表达模式.结果显示,VvLBD35和VvLBD36均含有α-螺旋、无规则卷曲和β-转角结构,VvLBD36还含有较多的β-折叠结构;VvLBD35和VvLBD36与拟南芥、水稻、玉米、柑橘和番茄等植物中的LBD蛋白都有较高的同源性;VvLBD35和VvLBD36的启动子区含有多种胁迫、激素以及生长发育相关的应答元件;VvLBD35和VvLBD36在根、茎、叶中均有不同程度的表达,且均在叶中表达量最高,约是根和茎中的2～8倍;诱导表达模式分析表明,VvLBD35受高温诱导最为显著,下调至约为对照的6％,而VvLBD36受高盐和高温的诱导最为显著,分别上调至对照的5.67倍和14.29倍.本研究为进一步深入揭示VvLBD35和VvLBD36的生物学功能奠定了实验基础.
关键词：葡萄LBD家族序列分析表达分析非生物胁迫
分类号：S663.1(果树园艺)Q786(基因工程（遗传工程）)
资助基金：山东省自然科学基金面上项目(ZR2022MC064)作物生物学国家重点实验室开放课题(2021KF06)潍坊学院博士科研基金项目(2023BS19)
论文发表日期：2024-08-28
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 23-29 )
英文信息