粉葛PtERF98基因克隆及表达分析
刘羽佳1
于白音1
罗可发2
何彬荣2
谢杰盈2
方晓婕2
刘博婷1
1.韶关学院广东省粤北食药资源利用与保护重点实验室,广东韶关 512005;韶关学院生物与农业学院,广东韶关 5120052.韶关学院生物与农业学院,广东韶关 512005
摘要:乙烯响应因子(ethylene responsive factors,ERF)是植物特有的一类转录因子,在乙烯信号转导通路、植物生长发育和逆境胁迫响应中起重要的调控作用.为探明PtERF98转录因子在粉葛(Pueraria thomsonii Benth.)块根采后生理性变质(post-harvest physiological deterioration,PPD)过程中的表达调控机制,本研究采用RT-PCR技术从火山粉葛叶组织中克隆PtERF98基因,并对其进行生物信息学、组织表达特异性分析和在PPD过程中的表达分析.结果显示,PtERF98基因CDS序列长450 bp,编码149个氨基酸残基;PtERF98蛋白理论分子量为16.93 kDa,理论等电点为8.06,为亲水性不稳定蛋白.蛋白结构分析显示,PtERF98具有典型的AP2保守结构域,属于ERF转录因子家族成员,定位于细胞核,无跨膜螺旋结构,含有1个信号肽和16个磷酸化位点.氨基酸序列同源性和系统进化关系分析表明,PtERF98与大豆(Glycine max)GmERF98同源性最高且亲缘关系最近.组织表达分析显示,PtERF98基因在火山粉葛的根、茎、叶中均有表达,且在不同组织中的相对表达量存在差异,叶中表达量最高.此外,PtERF98的表达受到PPD的显著诱导,表达水平随着PPD时间延长呈先升高后下降趋势,并在采后48 h达到最高,推测该基因可能参与粉葛块根的PPD过程.本研究可为深入了解PtERF98基因的功能及其在粉葛PPD过程中的表达调控作用奠定研究基础.
关键词:粉葛乙烯信号通路PtERF98转录因子采后生理性变质生物信息学分析表达分析
分类号:Q781(基因工程(遗传工程))S567.9(经济作物)
资助基金:国家自然科学基金(32000266)广东省基础与应用基础研究基金项目(2024A1515013167)广东省普通高校重点领域专项(2022ZDZX4044)韶关市科技计划项目(210805114531189)韶关学院重点项目(SZ2022KJ04)
论文发表日期:2024-09-28
在线出版日期:2026-05-22(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:7( 6-12 )
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山东农业科学

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CSTPCD北大核心
ISSN:1001-4942
年,卷(期):2024,56(9)
所属栏目:生物技术·遗传育种·种质资源