毛头鬼伞漆酶基因Cc_lac21的克隆及生物信息学和组织表达分析
牛鑫1
赵倩1
赵鑫2
柯善文1
郭金宝2
马振2
张建宁2
1.河西学院甘肃省应用真菌工程实验室/甘肃省食用菌遗传育种重点实验室/祁连山食用菌产业协同创新中心,甘肃张掖 734000;河西学院农业与生态工程学院,甘肃张掖 7340002.河西学院农业与生态工程学院,甘肃张掖 734000
摘要：为了确定毛头鬼伞基因组中漆酶基因Cc_lac21的"缺口"序列及可能的生理功能,本研究对其进行克隆和生物信息学分析,并以18S rDNA为内参基因,检测菌丝阶段以及商品成熟阶段子实体的菌盖、菌柄顶端和菌柄基部Cc_lac21的表达水平.结果表明,Cc_lac21基因全长2 243 bp,含有12个内含子、13个外显子,编码序列为1 452 bp,编码483个氨基酸.Cc_Lac21为稳定的亲水性蛋白,N端前17个氨基酸为信号肽序列,分泌到胞外;二级结构以无规则卷曲和延伸链为主;在28个丝氨酸(S)、21个苏氨酸(T)和5个酪氨酸(Y)上可能发生磷酸化修饰;在第286位的苏氨酸和第381位的丝氨酸处可能发生O-糖基化修饰;含有3个铜氧化蛋白结构域,分别是2个铜氧化还原蛋白超家族(cupredoxin super family)和1个云芝Tv-LCC样真菌漆酶的第三个铜氧化还原域(CuRO_3_Tv-LCC9);与鳞白环蘑漆酶的亲缘关系最近,包含3个基序.通过RT-qPCR分析发现,Cc_lac21 在菌丝体阶段和成熟菌柄基部表达量高,在菌盖和伸长生长的菌柄顶端表达量低,推测Cc_lac21可能参与基质木质素的降解以及菌柄中菌丝细胞壁的成熟过程.本研究结果可为探究漆酶基因参与菌柄细胞壁成熟机制奠定基础.
关键词：毛头鬼伞漆酶基因Cc_lac21生物信息学分析表达分析
分类号：Q781(基因工程（遗传工程）)S567.3(经济作物)
资助基金：甘肃省重点研发计划项目(21YF5NA127)河西学院高层次人才科研启动项目(KYQD2020038)甘肃省大学生创新创业训练计划项目(S202210740104)河西学院第十三批大学生科技创新项目(144)
论文发表日期：2024-09-28
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 13-21 )
英文信息