3种栗属植物SBP基因家族生物信息学与表达分析
付丽枝1
杨涌1
于克妍1
于立洋2
王旋2
张海娥2
1.河北科技师范学院园艺科技学院,河北 秦皇岛 066004;板栗产业技术教育部工程研究中心,河北 秦皇岛 066004;河北省特色园艺种质挖掘与创新利用重点实验室,河北 秦皇岛 0660042.板栗产业技术教育部工程研究中心,河北 秦皇岛 066004;河北省特色园艺种质挖掘与创新利用重点实验室,河北 秦皇岛 066004;河北省板栗产业协同创新中心,河北 秦皇岛 066004
摘要：SBP蛋白是一类广泛参与调节生长发育过程的植物特有转录因子.本研究从 3 种栗属植物中鉴定到 58 个SBP基因家族成员,并利用生物信息学方法对其染色体定位、蛋白理化性质、共线性关系等方面进行了分析.结果发现,所有栗属植物SBP基因家族成员在染色体上呈非均匀分布,其中 3 个SBP基因未被组装到染色体的大片段中.进化树分析发现栗属植物SBP基因家族可以分为 7 个小组,小组 5 中发生了基因的丢失和扩增.Motif分析发现所有SBP基因家族成员都包含保守的Motif1 或Motif2.共线性基因对的Ka/Ks分析发现,SBP基因家族成员在栗属植物基因组内及组间正在经历纯化选择.转录组数据分析发现CmSBP基因家族在不同时期中国板栗芽与果实中的表达量变化明显.本研究结果可为后续栗属植物SBP基因功能研究提供理论基础.
关键词：栗属植物SBP基因家族选择压力生物信息学分析表达分析
分类号：S664.2(果树园艺)
资助基金：国家重点研发计划(2022YFD2200400)河北科技师范学院博士启动基金项目(2023YB026)
论文发表日期：2025-05-30
在线出版日期：2026-05-22（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 36-45 )
英文信息