HCMV 60-mer寡核苷酸诊断芯片的探针与微阵列设计
张亚莉1
马文丽2
赵海全2
莫小阳2
郑文岭3
1.南方医科大学基因工程研究所,广东广州510515;贵阳医学院2.南方医科大学基因工程研究所,广东广州5105153.华南基因组研究中心
摘要:目的设计用于人巨细胞病毒(HCMV)诊断的60-mer长链寡核苷酸探针及微阵列.方法利用生物学软件Array Designer2.0,针对HCMV特异且保守的序列设计60-mer探针,利用BLAST功能将设计探针在GenBank数据库进行序列比对分析,筛选得到HCMV特异性Oligo探针,根据各探针的属性特点设计芯片阵列.结果设计得到24条解链温度(Tm值)相近、长度均一的60-mer Oligo探针及其芯片阵列,拟打印成DNA芯片用于HCMV检测.结论利用病原体的生物信息学资料及Array Designer2.0生物软件,能有效的进行病毒检测芯片的设计.
关键词:人巨细胞病毒寡核苷酸序列分析基因芯片Oligo探针
分类号:R372(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))
资助基金:广州市科技攻关计划(2001-Z-005-01)
论文发表日期:2006-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:2( 17-18 )
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山东医药

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ISSN:1002-266X
年,卷(期):2006,46(8)
所属栏目:论著