焦磷酸测序技术检测HBV基本核心启动子变异的研究
谈国蕾
吴引伟
文剑
赵磊
宋玉华
张亮
1.东南大学医学院附属南京市第二医院,江苏南京,2100032.东南大学医学院附属南京市第二医院,江苏南京,2100033.东南大学医学院附属南京市第二医院,江苏南京,2100034.东南大学医学院附属南京市第二医院,江苏南京,2100035.东南大学医学院附属南京市第二医院,江苏南京,2100036.东南大学医学院附属南京市第二医院,江苏南京,210003
摘要：目的 建立HBV基本核心启动子(BCP)区变异的快速检测方法.方法 采用焦磷酸测序(pyrosequencing)技术,设计一对引物,其中一条经生物素标记,PER扩增产物含HBV BCP A1762T/G1764A双突变的区域,借用生物素包被葡聚珠纯化单链PCR产物,设计一条测序引物,运用焦磷酸测序技术对A1762T/G1764A两个变异点进行变异分析.通过对已知变异类型的HBV分离株进行测定分析,评价所建立方法的检测敏感性和特异性.结果 PCR扩增后,可在2 h内得到A1762T/G1764A两个变异点的突变情况.所建立方法的检测灵敏度达到HBV-DNA血清中的含量为103copies/ml;在所分析的HBV BCP区均可检测出变异株、非变异株及混合株,且所检测的结果与直接测序方法结果符合率为95%.结论 Pyrosequencing技术用于检测病毒基因突变有高通量、自动化程度高和结果准确等特点,适用于对HBV BCP区突变进行快速高通量检测.
关键词：焦磷酸测序肝炎病毒乙型基本核心启动子变异
分类号：R575.1(消化系及腹部疾病)
资助基金：南京市省社会发展项目(BS2005603)
论文发表日期：2007-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：3( 14-16 )
英文信息